Μια ασθένεια αναζητά θεραπεία: Η διαρκής απειλή του δάγκειου πυρετού από μέλη της οικογένειας των φλαβοϊών. Μελέτη των πρωτεϊνών NS2B/NS3 ως πιθανός φαρμακευτικός στόχος

A disease is seeking treatment: The constant threat of Dengue Fever from members of the Flavivirus family. Study of NS2B/NS3 proteins as a potential pharmaceutical target (Αγγλική)

  1. MSc thesis
  2. Κρίνας, Χρήστος
  3. Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών των Φυσικών Επιστημών (ΚΦΕ)
  4. 25 Σεπτεμβρίου 2022 [2022-09-25]
  5. Ελληνικά
  6. 197
  7. Κοντοπίδης, Γιώργος
  8. Κοντοπίδης, Γιώργος | Σκορίλας, Ανδρέας
  9. Δάγκειος Ιός | Dengue Virus | Επιδημία | Epidemic | Αντι-ιικά φάρμακα | Antiviral Drugs | Εμβόλια | Vaccines | Πρωτεάση NS2b/NS3 | NS2b/NS3 Protease | Προσομοίωση Μοριακής Δυναμικής | Molecular Dynamics Simulation
  10. 4
  11. 2
  12. 175
  13. Περιέχει : σχήματα, πίνακες, διαγράμματα, εικόνες, φωτογραφίες
  14. Ι. Γεωργάτσος. Αρχές Βιοχημείας. Τόμος 2, Κεφάλαιο 9, Εκδόσεις ΕΑΠ, Πάτρα 1999
    • Ο δάγκειος ιός απασχολεί έντονα την παγκόσμια επιστημονική κοινότητα εδω και πολλές δεκαετίες. Είναι μια συνεχής υγειονομική απειλή με εκατομμύρια μολύνσεις και χιλιάδες θανάτους ετησίως. Ο δάγκειος ιός ανήκει στην οικογένεια των ιών Flaviviridae, που αποτελείται από περισσότερα από 70 μέλη, στο γένος Flavivirus και ευθύνεται για τον δάγκειο πυρετό, αλλά και θανάτους σε ανθρώπους και ζώα. Η οικογένεια των ιών Flaviviridae έχει RNA γενετικό υλικό και περιλαμβάνει μέλη που προκαλούν διάφορα επίπεδα παθογένειας, από ήπια έως πολύ σοβαρά. Η εξάπλωση του δάγκειου ιού στους ανθρώπους αυξάνεται με το πέρασμα των χρόνων και αυτό οφείλεται κυρίως λόγω της συνεχούς κλιματικής αλλαγής, της αύξησης του παγκόσμιου πληθυσμού αλλά και λόγω της ανάπτυξης των δικτύων μετακίνησης σε παγκόσμιο επίπεδο. Παρά τις συστηματικές προσπάθειες που γίνονται για την αντιμετώπιση του ιού στον τομέα της ανάπτυξης νέων φαρμάκων και στον τομέα των εμβολίων, προς το παρόν δεν έχει βρεθεί αποτελεσματική θεραπεία. Η αντιμετώπιση των τεσσάρων ορότυπων του δάγκειου ιού προς το παρόν περιορίζεται σε προσπάθειες ελέγχου του πληθυσμού των κουνουπιών του γένους Aedes, που είναι φορείς της νόσου, καθώς και με χρήση ενός εμβολίου που έχει περιορισμένη εφαρμογή στον γενικό πληθυσμό. Σκοπός της παρούσας διπλωματικής εργασίας είναι να γίνει μια ολοκληρωμένη παρουσίαση για τη σοβαρή υγειονομική απειλή που διαρκεί πολλές δεκαετίες και οφείλεται στους τέσσερις ορότυπους του δάγκειου ιού της οικογένειας των ιών Flaviviridae. Η δομή της εργασίας ξεκινά με το πρώτο κεφάλαιο που αποτελεί μια εισαγωγή στους ιούς. Εν συνεχεία στο δεύτερο κεφάλαιο γίνεται μια επισκόπηση της οικογένειας των ιών Flaviviridae. Στο τρίτο κεφάλαιο γίνεται μια ενδελεχής παρουσίαση του δάγκειου ιού όσον αφορά την προέλευση, τον κύκλο ζωής, τη μορφολογία, τις πρωτεΐνες του ιού, τις επιπτώσεις στην οικονομία, καθώς και τις προσπάθειες αντιμετώπισης της απειλής. Το τέταρτο κεφάλαιο επικεντρώνεται στις πρωτεΐνες NS2b/NS3 στους τέσσερις ορότυπους του δάγκειου ιού, που έχει χαρακτηριστεί ως ένας σημαντικός φαρμακευτικός στόχος. Γίνεται μια λεπτομερής παρουσίαση στις προσπάθειες των ερευνητών να ανακαλύψουν μόρια αναστολείς που στοχεύουν την ιική πρωτεάση NS2b/NS3, καθώς και των θέσεων πρόσδεσης που έχουν εντοπιστεί. Θα παρουσιαστεί η μεθοδολογία που ακολουθήθηκε για τη μελέτη του πρωτεϊνικού συμπλόκου NS2b/NS3 για τον ορότυπο 2 του δάγκειου ιού, με προσομοίωση μοριακής δυναμικής. Στο πέμπτο κεφάλαιο παρουσιάζονται τα αποτελέσματα της προσομοίωση μοριακής δυναμικής και τα συμπεράσματα που προκύπτουν, καθώς επίσης και η παρουσίαση της νέας θέσης που προσδιορίστηκε στην ιική πρωτεάση NS2b/NS3, η οποία πιθανόν να αποτελέσει ένα νέο σημείο πρόσδεσης για στόχευση φαρμάκων.
    • Dengue virus has been a major concern of the global scientific community for many decades. It is a constant health threat with millions of infections and thousands of deaths each year. Dengue virus belongs to Flaviviridae family of viruses, which consists of more than 70 members, to Flavivirus genus and is responsible for dengue fever, as also for deaths in humans and animals. The Flaviviridae family of viruses has RNA genetic material and includes members that cause various levels of pathogenesis, from mild to very severe. The spread of dengue virus in humans is increasing over the years and this is mainly due to the constant climate change, the increase of the world population, as also due to the development of transportation networks at global level. Despite the systematic efforts to tackle the virus in the development of new medicines and vaccines, no effective cure has been found so far. Treatment of the four dengue virus serotypes is currently limited at efforts to control the population of Aedes mosquitoes that carry the disease, as well as the use of a vaccine with limited application to the general population. The purpose of this dissertation is to comprehensively present the serious health threat that lasts for decades and is due to the four serotypes of the dengue virus from Flaviviridae family. The structure of this work begins with the first chapter which is an introduction to viruses. In the second chapter, an overview of the Flaviviridae family of viruses is presented. The third chapter provides a thorough overview of dengue virus in terms of origin, life cycle, morphology, proteins of the virus, its effects on the economy, as also the efforts to address the threat. The fourth chapter focuses on the NS2b/NS3 proteins of the four serotypes of dengue virus, which has been identified as an important drug target. A detailed presentation is made on the researchers' efforts to discover inhibitor molecules targeting the NS2b/NS3 viral protease, as well as the binding sites that have been identified. The methodology followed for the study of the NS2b/NS3 protein complex of the dengue virus serotype 2, by using molecular dynamics simulation, will be presented. The fifth chapter presents the results of the molecular dynamics simulation and the conclusions that emerge, as well as the presentation of the new site identified in the NS2b/NS3 viral protease, which is a potential new binding site for drug targeting.
  16. Items in Apothesis are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.