Η ανίχνευση και ταυτοποίηση μικροοργανισμών στα αστικά υγρά απόβλητα αποτελεί σημαντικό πεδίο έρευνας, καθώς συνδέεται άμεσα με τη δημόσια υγεία, την προστασία του περιβάλλοντος και τη βιώσιμη διαχείριση των υδατικών πόρων. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η διερεύνηση και αξιολόγηση των κυριότερων σύγχρονων μεθόδων που εφαρμόζονται για τον προσδιορισμό της μικροβιακής σύστασης και την εκτίμηση της μικροβιακής επιβάρυνσης των αστικών υγρών αποβλήτων πριν και μετά την επεξεργασία τους.

   Αρχικά παρουσιάζονται οι συμβατικές καλλιεργητικές τεχνικές, οι οποίες, παρά την αξιοπιστία τους, εμφανίζουν περιορισμούς ως προς τον χρόνο ανάλυσης και την ανίχνευση μη καλλιεργήσιμων μικροοργανισμών. Στη συνέχεια αναλύονται οι μοριακές μέθοδοι, όπως η PCR και οι παραλλαγές της, καθώς και οι σύγχρονες τεχνολογίες αλληλούχησης νέας γενιάς (NGS), που επιτρέπουν την ταχεία και ολοκληρωμένη μελέτη των μικροβιακών κοινοτήτων. Παρουσιάζονται επίσης ανοσολογικές τεχνικές, όπως η ELISA, καθώς και νεότερες τεχνολογίες, όπως οι βιοαισθητήρες και η φασματομετρία μάζας MALDI-TOF MS.

   Η γνώση της μικροβιακής σύστασης των λυμάτων συμβάλλει στην επιδημιολογική επιτήρηση, στη βελτίωση των διεργασιών επεξεργασίας και στην αξιολόγηση της ποιότητας των επεξεργασμένων εκροών. Η αποτελεσματική παρακολούθηση σύνθετων περιβαλλοντικών δειγμάτων, όπως τα αστικά υγρά απόβλητα, απαιτεί τον συνδυασμό διαφορετικών αναλυτικών μεθόδων, ώστε να επιτυγχάνεται πιο ολοκληρωμένη, ακριβής και αξιόπιστη εκτίμηση της μικροβιακής τους σύστασης.

   The detection and identification of microorganisms in municipal wastewater constitute an important field of research, as they are directly related to public health protection, environmental sustainability, and water resource management. The aim of this study is to investigate and evaluate the principal contemporary methods used to determine the microbial composition and assess the microbial load of municipal wastewater before and after treatment.

   Initially, conventional culture-based techniques are presented, which, despite their reliability, exhibit limitations regarding analysis time and the detection of non-culturable microorganisms. Subsequently, molecular methods, such as polymerase chain reaction (PCR) and its variants, as well as advanced technologies such as Next-Generation Sequencing (NGS), are discussed, as they enable rapid, sensitive, and comprehensive characterization of microbial communities. Immunological techniques, such as ELISA, together with emerging technologies including biosensors and MALDI-TOF MS, are also examined.

   Knowledge of the microbial composition of wastewater contributes to epidemiological surveillance, the optimization of wastewater treatment processes, and the assessment of the quality of treated effluents. Effective microbial monitoring of complex environmental samples, such as municipal wastewater, requires the integration of different analytical methods in order to achieve a more comprehensive, accurate  and reliable characterization of their microbial composition.