Η χρήση του έλευθερου εμβρυϊκού κυκοφορούν DNA (cell free fetal DNA, cffDNA) στον προγεννητικό έλεγχο έχει αναδειχθεί ως μια πρωτοποριακή προσέγγιση, επιτρέποντας τη μη επεμβατική ανίχνευση χρωμοσωμικών ανωμαλιών όπως η τρισωμία 21, 18 και 13 με υψηλή ευαισθησία και ειδικότητα. Χρησιμοποιώντας προηγμένες τεχνολογίες προσδιορισμού αλληλουχίας, ο μη επεμβατικός προγεννητικός έλεγχος (Non Invasive Prenatal Testing, NIPT) περιλαμβάνει την ανάλυση θραυσμάτων cfDNA εμβρύου που υπάρχουν στο μητρικό αίμα για την ανίχνευση κοινών χρωμοσωμικών ανωμαλιών, αλλά και άλλων γενετικών διαταραχών. Η εξαγωγή και ο προσδιορισμός της αλληλουχίας του cfDNA προσφέρουν μια ασφαλή και ακριβή εναλλακτική λύση στις επεμβατικές δοκιμές, όπως η αμνιοπαρακέντηση, που παρέχουν υψηλή ευαισθησία και ειδικότητα στην ανίχνευση τέτοιων διαταραχών. Η μη επεμβατική φύση της ανάλυσης cfDNA μειώνει τους κινδύνους που σχετίζονται με επεμβατικές δοκιμές, προσφέροντας στους μέλλοντες γονείς μια αξιόπιστη μέθοδο για την έγκαιρη ανίχνευση γενετικών παραλλαγών του εμβρύου.

Στις μεθοδολογίες που χρησιμοποιούνται στο NIPT με βάση το cffDNA, συμπεριλαμβάνεται ο διαχωρισμός του εμβρυικού από το μητρικό DNA, οι τεχνικές προσδιορισμού της αλληλουχίας, που επιτυγχάνεται κυρίως με μεθόδους που βασίζονται στην αλληλούχηση νέας γενιάς (Next Generation Sequencing, NGS), ακόμα και η ερμηνεία των αποτελεσμάτων.

Διάφορα εμπορικά διαθέσιμα κιτ έχουν αναπτυχθεί για τον μη επεμβατικό προγεννητικό έλεγχο, υπογραμμίζοντας τα χαρακτηριστικά απόδοσης και την κλινική τους χρησιμότητα στην ανίχνευση κοινών χρωμοσωμικών ανωμαλιών. Καθένα από αυτά χαρακτηρίζεται από τα  δυνατά του σημεία, τους περιορισμούς και τις επιπτώσεις του στον μη επεμβατικό προγεννητικό έλεγχο.

Η γενετική συμβουλευτική αναδεικνύεται ως ένα κρίσιμο σημείο του προγεννητικού ελέγχου, καθώς διευκολύνει τη λήψη τεκμηριωμένων αποφάσεων, την ερμηνεία των αποτελεσμάτων και την καθοδήγηση των γονέων.

Συμπερασματικά, σκοπός αυτής της εργασίας είναι να υπογραμμίσει τη σημασία του cffDNA στον σύγχρονο προγεννητικό έλεγχο και στη βελτίωση της ανίχνευσης γενετικών ανωμαλιών στο έμβρυο, αποσαφηνίζοντας τις μεθοδολογίες, τα εμπορικά παρεχόμενα κιτ και τις εκτιμήσεις γενετικής συμβουλευτικής που σχετίζονται με την ανάλυση του cffDNA.

The use of cell-free fetal DNA (cffDNA) in prenatal testing is considered as a groundbreaking approach, enabling the non-invasive detection of chromosomal abnormalities such as trisomy 21, 18, and 13 with high sensitivity and specificity. Non-Invasive Prenatal Testing (NIPT) utilizes advanced sequencing technologies to analyze fragments of fetal cffDNA present in maternal blood for the detection of common genetic disorders. The extraction and sequencing of cffDNA provide a safe and accurate alternative to invasive tests such as amniocentesis, offering high sensitivity and specificity in identifying these disorders. The non-invasive nature of cffDNA analysis mitigates the risks associated with invasive testing, providing a reliable method for early detection of fetal genetic variants for parents.

The methodology used in cffDNA-based NIPT includes the separation of fetal DNA from maternal DNA, sequencing techniques primarily achieved through Next-Generation Sequencing (NGS)-based methods, and result interpretation.

Several commercially available kits have been developed for non-invasive prenatal testing, showcasing their performance characteristics and clinical utility in detecting common chromosomal abnormalities. Each kit is distinguished by its strengths, limitations, and implications for non-invasive prenatal testing.

Genetic counseling is recognized as a crucial aspect of prenatal testing, aiding in informed decision-making, result interpretation, and parental guidance.

In conclusion, this thesis aims to underscore the importance of cffDNA in current prenatal testing and enhance the detection of genetic abnormalities in the fetus by elucidating the methodologies, commercially available kits, and genetic counseling considerations.