Στο πρώτο κεφάλαιο γίνεται μία εισαγωγή των όσων θα ακολουθήσουν καθώς αναφέρεται και η σπουδαιότητα της μαθηματικής βιολογίας. Επίσης, εισάγονται σημαντικές έννοιες χρήσιμες για την κατανόηση των επόμενων κεφαλαίων.

Στο δεύτερο και τρίτο κεφάλαιο θα μιλήσουμε για σημαντικούς ορισμούς και έννοιες που αποτελούν βασικό υπόβαθρο για την κατανόηση των φυσικών φαινομένων που θα αναλυθούν στη συνέχεια, όπως η μαθηματική μοντελοποίηση, οι χημικές αντιδράσεις, τα είδη αυτών, καθώς και το ρόλο των ενζύμων στις χημικές αντιδράσεις.

Στο τέταρτο κεφάλαιο μελετάται η χημική κινητική και γίνεται αναφορά σε σημαντικές θεωρίες όπως ο νόμος δράσης μαζών, η θεωρία της μεταβατικής κατάστασης Eyring, η εξίσωση Arrhenious καθώς και τα μοντέλα χημικών αντιδράσεων Lotka-Volterra και Michaelis-Menten.

Στο πέμπτο κεφάλαιο αναλύεται η υπόθεση της σχεδόν στατικής κατάστασης Michaelis-Menten, όπου όπως υποδηλώνει και το όνομα της υπόθεσης, είναι η κατάσταση όπου η συγκέντρωση ορισμένων μοριακών ειδών παραμένει αμετάβλητη σε μία χημική αντίδραση.

The first chapter is an introduction to what will be studied and in reference to the importance of mathematical biology. We will also introduce concepts that are useful in understanding the following chapters.

In the second and third chapters we will discuss important terminologies and concepts that are substantial for understanding the physical phenomena we will further analyse, such as mathematical modeling, chemical reactions, their types, as well as the role of enzymes in chemical reactions.

In the fourth chapter, we examine chemical kinetics, in reference to the importance of theories such as the law of mass action , transition state theory of Eyring, the Arrhenius equation as well as the Lotka-Volterra and Michaelis-Menten chemical reaction models.

The fifth chapter analyses the hypothesis of the quasi-steady state assumption of Michaelis-Menten, QSSA, where, as the name of the hypothesis suggests, the state of concentration of certain molecular species remain unchanged in a chemical reaction.