Η ελεγκτική επιστήμη, ως κλάδος της οικονομικής επιστήμης, χωρίζεται στην εσωτερική, εξωτερική και κρατική ελεγκτική. Ο φορολογικός έλεγχος είναι το κύριο αντικείμενο της κρατικής ελεγκτικής και το κυριότερο μέσον αύξησης των δημοσίων εσόδων. Η είσπραξη φόρων αποτελεί την σημαντικότερη πηγή αύξησης των εσόδων ενός κράτους όμως η φοροδιαφυγή οδηγεί σε πλήγμα και χαμηλότερα έσοδα. Για την αντιμετώπισή της διενεργούνται οι φορολογικοί έλεγχοι. Ο φορολογικός έλεγχος διαδραματίζει καθοριστικό ρόλο καθώς συμβάλλει τόσο στην καταπολέμηση της φοροδιαφυγής και φοροαποφυγής, όσο και στην αύξηση των δημοσίων εσόδων, στην επιτάχυνση της οικονομικής ανάπτυξης του ελληνικού κράτους καθώς, στη δίκαιη κατανομή των φορολογικών βαρών και στη συμμόρφωση των πολιτών. Στην παρούσα διπλωματική εργασία θα ερευνηθεί η αποτελεσματικότητα του φορολογικού ελέγχου στην Ελλάδα και η συνεισφορά του στην αντιμετώπιση της φοροδιαφυγής καθώς και οι μεταβλητές που την επηρεάζουν. Θα αναλυθεί η έννοια, η σημασία και οι στόχοι του φορολογικού ελέγχου. Θα παρουσιαστούν  οι μέθοδοι, οι τεχνικές και οι διαδικασίες που χρησιμοποιούνται κατά διενέργεια ενός φορολογικού ελέγχου. Για την παρούσα διπλωματική εργασία δημιουργήθηκε εμπειρική έρευνα με ερωτηματολόγια με ερωτήσεις κλειστού τύπου τα οποία απευθύνθηκαν σε εφοριακούς υπαλλήλους και κυρίως σε ελεγκτές της Ανεξάρτητης Αρχής δημοσίων Εσόδων. Τα αποτελέσματα αναλύθηκαν μέσω της περιγραφικής στατιστικής και έδειξαν σε πόσο σημαντικό βαθμό επηρεάζουν την αποτελεσματικότητα του φορολογικού ελέγχου τα πληροφοριακά συστήματα, η επιμόρφωση των φορολογικών ελεγκτών, η συχνότητα των φορολογικών ελέγχων και άλλοι παράγοντες. Ιδιαίτερη βαρύτητα δόθηκε στον ρόλο της αρχής επανεξέτασης /επανελέγχου που έρχεται μετά τον έλεγχο για να επιλύσει τυπικά θέματα και θέματα ουσίας καθώς και στη δημιουργία των ελεγκτικών κέντρων που βασικός τους στόχος είναι η μεγιστοποίηση  των εσόδων,  η αύξηση της αποτελεσματικότητας των φορολογικών ελέγχων και η καταπολέμηση της φοροδιαφυγής και φοροαποφυγής. Στο τέλος της διπλωματικής εργασίας αναφέρονται κάποιες προτάσεις για μελλοντική έρευνα.