Ο καρκίνος του μαστού αποτελεί μια από τις συχνότερες μορφές καρκίνου στις
γυναίκες παγκοσμίως, με υψηλό ποσοστό νοσηρότητας και θνησιμότητας. Η
κατανόηση των μοριακών μηχανισμών που οδηγούν στην ανάπτυξη και την εξέλιξή
του αποτελεί σημαντικό ερευνητικό πεδίο, με στόχο τη βελτίωση της διάγνωσης και
της θεραπείας. Ένας από τους πιο αποτελεσματικούς τρόπους για την κατανόηση
των ενδογενών μηχανισμών είναι η μελέτη των επιπέδων έκφρασης γονιδίων που
παίζουν ρυθμιστικό ρόλο σε μονοπάτια σηματοδότησης. Η πιο αποτελεσματική
μέθοδος που παρέχει μία ολοκληρωμένη εικόνα του ποσοστού της γονιδιακής
έκφρασης είναι η αλληλούχηση επόμενης γενιάς (RNA-sequencing). Στόχο της
παρούσας διπλωματικής εργασίας αποτελεί η ανάλυση δεδομένων RNA-sequencing
που αφορά συγκεκριμένους υπότυπους καρκίνου μαστού μέσω στοχευμένων
πειραματικών μοντέλων με χρήση κατάλληλων υπολογιστικών εργαλείων για την
επεξεργασία και οπτικοποίηση των ανωτέρω συνόλων δεδομένων. Παράλληλα
πραγματοποιήθηκε η ταυτοποίηση διαφορικώς εκφραζόμενων γονιδίων σε διάφορα
κυτταρικά περιβάλλοντα τα οποία εν δυνάμει μπορούν να αποτελέσουν
υποψήφιους βιοδείκτες για τη διάγνωση ή την πρόγνωση της νόσου και η
καταγραφή τους σε βιολογικές διεργασίες και ενδοκυτταρικά μονοπάτια που
σχετίζονται με μηχανισμούς ανθεκτικότητας για πιθανούς θεραπευτικούς στόχους