Μοριακό υπόβαθρο και σύγχρονη μοριακή διάγνωση νόσων επαγόμενων από επέκταση νουκλεοτιδικών επαναλήψεων: Η περίπτωση της νόσου του Huntington

Molecular background and modern molecular diagnosis of Nucleotide Repeat Expansion-Induced Diseases: the case of Huntington's disease (english)

  1. MSc thesis
  2. ΠΑΝΑΓΙΩΤΗΣ ΦΡΑΓΚΟΣ
  3. Χημική και Βιομοριακή Ανάλυση (ΧΒΑ)
  4. 5 March 2023
  5. Ελληνικά
  6. 150
  7. ΤΣΟΥΜΑΝΗ ΚΩΝΣΤΑΝΤΙΝΑ
  8. ΤΣΟΥΜΑΝΗ, ΚΩΝΣΤΑΝΤΙΝΑ | ΜΑΡΚΟΠΟΥΛΟΥ , ΣΟΥΛΤΑΝΑ | ΣΤΑΘΟΠΟΥΛΟΣ, ΚΩΝΣΤΑΝΤΙΝΟΣ
  9. Huntington, PCR , Southern, τριχοειδής ηλεκτροφόρηση, NGS, Μοριακός καρυότυπος
  10. ΧΗΜΙΚΗ ΚΑΙ ΒΙΟΜΟΡΙΑΚΗ ΑΝΑΛΥΣΗ
  11. 340

    • Στην παρούσα μελέτη διερευνώνται και αναλύονται οι κύριοι μοριακοί μηχανισμοί που εμπλέκονται στις επεκτάσεις των νουκλεοτιδίων στο DNA και RNA κατά την αντιγραφή, την μεταγραφή, την μετάφραση και την επιδιόρθωση του DNA σε διάφορες περιοχές των γονιδίων και οι οποίες έχουν αρνητική επίδραση προκαλώντας σοβαρές ασθένειες στον άνθρωπο και για τις οποίες  το περισσότερο των περιπτώσεων είναι δύσκολη η θεραπεία και η αντιμετώπιση.                                                                                    Επίσης αναλύεται μια νευροεκφυλιστική ασθένεια επέκτασης τρινουκλεοτιδίου η νόσος του Huntington(HD). Στην εργασία αναλύεται ο τρόπος κληρονομικότητας, οι μέθοδοι διάγνωσης, οι μοριακοί μηχανισμοί που την προκαλούν, καθώς και οι επιπτώσεις στον ανθρώπινο οργανισμό που αφορά κυρίως το νευρικό σύστημα.                                    Στη συνέχεια γίνεται μια εκτεταμένη αναφορά σε σύγχρονες μοριακές μεθόδους για την διάγνωση της επέκτασης των νουκλεοτιδίων στο DNA. Συγκεκριμένα περιγράφονται οι βασικές αρχές των μεθόδων που χρησιμοποιούνται για την διάγνωση της HD και οι οποίες αφορούν παραλλαγές της ενίσχυσης των επαναλήψεων με PCR και την ακόλουθη ταυτοποίησή τους με απλή ή τριχοειδή ηλεκτροφόρηση αλλά και με μέθοδο Southern. Eπιπλέον παρουσιάζεται η διαδικασία ανίχνευσης με καμπύλη τήξης και αλληλούχησης επόμενης γενiάς (NGC).                                                                      Eπιπλέον παρουσιάζονται συγκριτικά οι μεθοδολογίες και τίθενται κάποια ερωτήματα γύρω από τις επεκτάσεις νουκλεοτιδικών αλληλουχιών και τους τρόπους διάγνωσης και αντιμετώπισης των ασθενειών που προκαλούνται από αυτές.                   


    • In the present study, the main molecular mechanisms involved in DNA and RNA nucleotide expansions during DNA replication, transcription, translation and repair in various gene regions are examined due to their negative effect in causing severe hereditary diseases in humans which most of the cases are difficult to treat. It is also examined in detail the Huntington's disease (HD) as a case of a neurodegenerative trinucleotide expansion disease . The study analyzes the inheritance mode, the available diagnostic methods, the underlying molecular mechanisms that cause it, as well as its effects on the human body that mainly concern the nervous system and the possible treatment of this disease. Next, an extensive report is made on modern molecular methods for the diagnosis of nucleotide extension in DNA. In particular, the basic principles of the methods used for the diagnosis of HD are described, concerning the variant types of repeat amplification by PCR and their subsequent identification by simple and capillary electrophoresis as well as by Southern analysis. In addition, the detection process by melt curve analysis and next-generation sequencing (NGS) are also presented. At cytogenetic level, the techniques based on molecular karyotyping and array CGH analysis are also reported. Finally, the described methods are presented comparatively and some raised issues are discussed regarding the repeat expansions and the diagnosis and treatment processes of repeat caused disorders.
  13. Hellenic Open University
  14. Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές