- MSc thesis
- Βιοπληροφορική και Νευροπληροφορική (ΒΝΠ)
- 19 February 2023
- Ελληνικά
- 72
- ΗΛΙΑΣ ΛΑΓΚΟΥΒΑΡΔΟΣ
- ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ ΑΜΑΝΑΤΙΔΗΣ | ΠΑΝΑΓΙΩΤΗΣ ΒΛΑΜΟΣ
- Μικροβίωμα εντέρου, Τσιπούρα, ζυμομύκητας, αλληλούχηση νέας γενιάς
- Βιοπληροφορική και Νευροπληροφορική/ ΒΝΠ/ΔΕ
- 2
- 76
-
-
Πραγματοποιήθηκε διατροφικό πείραμα εβδομήντα (70) ημερών για να διερευνηθούν οι επιδράσεις της διαιτητικής χορήγησης ως προβιοτικού συστατικού του ζυμομύκητα Rhodotorula mucilaginosa στο εντερικό μικροβίωμα νεαρών ατόμων τσιπούρας (Sparus aurata) εκτρεφόμενα σε κλειστό σύστημα υδατοκαλλιέργειας. Για την μελέτη του εντερικού μικρόκοσμου χρησιμοποιήθηκαν τεχνικές αλληλούχησης νέας γενιάς και η ανάλυση και επεξεργασία των δεδομένων έγινε στη γλώσσα προγραμματισμού R μέσω του κώδικα Rhea. Τα άτομα Τσιπούρας κατανεμήθηκαν σε τέσσερις ίσες ομάδες, με τρεις επαναλήψεις έκαστη. Το σιτηρέσιο της ομάδας ελέγχου (Control ή FM) αποτελούνταν από σιτηρέσιο τυπικό για το είδος ενώ στις υπόλοιπες ομάδες RM1, RM2 & RM3 προστέθηκε ως προβιοτικό συστατικό ο ζυμομύκητας Rhodotorula mugilaginosa σε ποσοστό 1%, 2% και 3%, αντίστοιχα, με σκοπό τη βελτίωση του χρωματισμού του ψαριού. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι στα άτομα που χορηγήθηκε το προβιοτικό συστατικό δεν επηρεάστηκε δραστικά ο μικροβιακός πλούτος, δηλαδή η αφθονία σε μικρόβια. H άλφα-ποικιλότητα, οι δείκτες Shannon και Simpson καθώς η δραστική ποικιλότητα και ο δραστικός πλούτος (effective diversity & effective richness) αυξήθηκαν άλλα όχι σε στατιστικώς σημαντικά επίπεδο, ενώ διαφοροποιήθηκε στατιστικώς σημαντικά η σύσταση των μικροβιακών τους κοινοτήτων.
-
A seventy (70) day feeding experiment was conducted to investigate the effects of dietary administration as a probiotic component of the yeast Rhodotorula mucilaginosa on the gut microbiome of juvenile gilt-head (sea) bream (Sparus aurata) reared in a recirculating aquaculture system. For the study of the intestinal microcosm, new generation sequencing techniques were used and the analysis and processing of the data was executed in the R programming language through the Rhea. Seabream individuals were divided into four equal groups, with three replicates each. The diet of the control group (Control or FM) consisted of a diet typical for the species, while in the remaining groups RM1, RM2 & RM3, the yeast Rhodotorula mugilaginosa was added as a probiotic ingredient at a rate of 1%, 2% and 3%, respectively, in order to improving the coloring of the fish. The results showed that the microbial richness, i.e. the abundance of microbes, was not drastically affected in the subjects given the probiotic component. The alpha-diversity, the Shannon and Simpson indices as well as the effective diversity and effective richness (effective diversity & effective richness) increased, but not at a statistically significant level, while the composition of their microbial communities was significantly differentiated.
-
- Hellenic Open University
- Items in Apothesis are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.