Εφαρμογές Γράφων στα Πλαίσια One Health και Υλοποίησή τους στην R

Application of Graphs in a One Health framework and Implementation in R code (Αγγλική)

  1. MSc thesis
  2. Σιδέρη, Ιφιγένεια
  3. Βιοπληροφορική και Νευροπληροφορική (ΒΝΠ)
  4. 23 Ιουλίου 2022 [2022-07-23]
  5. Ελληνικά
  6. 113
  7. Ματζάκος, Νικόλαος
  8. Αμανατίδης, Δημήτριος | Χατζηνικολάου, Μαρία
  9. One Health | MSG | SSG | γράφοι | μικροβιακή αντοχή | γράφοι διεργασιών | graphs | antibiotic resistance | P-graphs
  10. 1
  11. 1
  12. 86
  13. Περιέχει: πίνακες, σχήματα, εικόνες
    • Η προσέγγιση One Health, που αναγνωρίζει πόσο άρρηκτα συνδεδεμένες είναι η υγεία και ευημερία του περιβάλλοντος, των ζώων και των ανθρώπων, αποτελεί μια τάση που διαρκώς κερδίζει έδαφος στις επιστήμες υγείας τα τελευταία χρόνια. Φλέγοντα ζητήματα των τελευταίων ετών: οι ζωονοσογόνες ασθένειες που πλήττουν τελευταία την ανθρωπότητα όπως η πρόσφατη πανδημία ή η κατά πολλούς “πανδημία του μέλλοντος” της μικροβιακής αντοχής στα αντιβιοτικά, καθιστούν επιτακτική μια πιο ολιστική προσέγγιση σε τόσο σύνθετα προβλήματα. Οι γράφοι και η θεωρία γράφων, που έχει βρει εδώ και χρόνια εφαρμογή σε τομείς της υγείας, μπορεί να βρει εφαρμογή και εδώ, κατά μήκος όλων των επιπέδων ανάλυσης One Health, από μια ασθένεια σε επιδημιολογικούς, σε γράφους επιπέδου οικοσυστήματος. Ειδικά στο τελευταίο αυτό επίπεδο, προτείνεται ο δανεισμός των Process graphs από το σχεδιασμό διεργασιών για την καλύτερη κατανόηση των κομβικών πτυχών ενός ζητήματος One Health στο οικοσύστημα. Υλοποιούνται με κάποιους συνδυαστικούς αλγόριθμους σε R, και εφαρμόζονται σε παραδείγματα κατανόησης και σχεδιασμού παρεμβάσεων, όπως στον τομέα επικράτησης μικροβίων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά.
    • The One Health framework, that advocates the crucial interconnection between environmental, animal and human health and well-being is becoming of increasing importance and acceptance in health sciences over the last years. The hottest public health topics of the latest years, like zoonotic diseases (as for example the recent pandemic) or the by many characterized as “pandemic of the future” increasing antibiotic resistance make the more holistic and combinatorial approach of One Health a necessity to combat such complex problems. Multiple graphs and graph theory have found applications in health sciences for many years, and they can now extend to usage across all levels of a One Health approach to health, ranging from genome, one disease level, to epidemiology and ecosystem graphs. For that last ecosystem layer, a proposed approached is the utilization of Process Graphs from the chemical engineering field, in order to understand a whole system and what constitute the most crucial aspects of a One Health issue in ecosystem level. Here P-graphs are implemented alongside their combinatorial algorithms in R, and later applied in an effort to extract information and plan interventions, for example on the issue of antibiotic resistance.
  15. Αναφορά Δημιουργού 4.0 Διεθνές