Μοντελοποίηση και ανάλυση κυτταρικών συστημάτων για την εύρεση κοινών μηχανισμών στις Νευροεκφυλιστικές ασθένειες

  1. MSc thesis
  2. ΑΔΑΜ, ΚΩΛΕΤΗΣ
  3. Βιοπληροφορική και Νευροπληροφορική (ΒΝΠ)
  4. 29 Μαρτίου 2021 [2021-03-29]
  5. Ελληνικά
  6. Θεωρία Γράφων | Βιολογία συστημάτων
  7. Ο νευροεκφυλισμός αναφέρεται σε μια ετερογενή ομάδα εγκεφαλικών διαταραχών που εξελίσσονται προοδευτικά. Έχει εκτιμηθεί ότι οι νευροεκφυλιστικές ασθένειες επικαλύπτονται σε πολλά επίπεδα. Ωστόσο, οι παραδοσιακές προσεγγίσεις κλινικοπαθολογικής έρευνας έχουν περιορισμένες δυνατότητες στην ανακάλυψη του συσχετισμού τους λαμβάνοντας υπόψη ετερογενείς πληροφορίες. Η Βιολογία Συστημάτων (Systems Biology) και οι αναλύσεις σε επίπεδο ανάλυσης δικτύων της Μοριακής Βιολογίας μπορεί να αποκρυπτογραφήσει σημαντικούς κοινούς μηχανισμούς στις νευροεκφυλιστικές ασθένειες, ανοίγοντας νέους δρόμους για την αποτελεσματικότερη αντιμετώπισή τους. Στην παρούσα εργασία, προτείνεται ένα μεθοδολογικό πλαίσιο το οποίο ιεραρχεί τα γονίδια τα οποία έχουν σημαντικό συνδετικό ρόλο στις νευροεκφυλιστικές διεργασίες. Η ιεράρχηση αυτή επιτυγχάνεται μέσα από μια κατασκευή ενός ομικού δικτύου που σχετίζεται με τις νευροεκφυλιστικές ασθένειες καθώς επίσης και από μια σειρά τοπολογικών μετρικών οι οποίες εντοπίζουν την σημαντικότητα των γονιδίων μέσα σε όλο το δίκτυο. Τα αποτελέσματα της παρούσας εργασίας έδειξαν γονίδια με ισχυρή συσχέτιση με διεργασίες που σχετίζονται με το νευροεκφυλισμό. Η μεθοδολογία υλοποιήθηκε στη γλώσσα R και διατίθεται ως λογισμικό ανοιχτού κώδικα.
    • Ο νευροεκφυλισμός αναφέρεται σε μια ετερογενή ομάδα εγκεφαλικών διαταραχών που εξελίσσονται προοδευτικά. Έχει εκτιμηθεί ότι οι νευροεκφυλιστικές ασθένειες επικαλύπτονται σε πολλά επίπεδα. Ωστόσο, οι παραδοσιακές προσεγγίσεις κλινικοπαθολογικής έρευνας έχουν περιορισμένες δυνατότητες στην ανακάλυψη του συσχετισμού τους λαμβάνοντας υπόψη ετερογενείς πληροφορίες. Η Βιολογία Συστημάτων (Systems Biology) και οι αναλύσεις σε επίπεδο ανάλυσης δικτύων της Μοριακής Βιολογίας μπορεί να αποκρυπτογραφήσει σημαντικούς κοινούς μηχανισμούς στις νευροεκφυλιστικές ασθένειες, ανοίγοντας νέους δρόμους για την αποτελεσματικότερη αντιμετώπισή τους. Στην παρούσα εργασία, προτείνεται ένα μεθοδολογικό πλαίσιο το οποίο ιεραρχεί τα γονίδια τα οποία έχουν σημαντικό συνδετικό ρόλο στις νευροεκφυλιστικές διεργασίες. Η ιεράρχηση αυτή επιτυγχάνεται μέσα από μια κατασκευή ενός ομικού δικτύου που σχετίζεται με τις νευροεκφυλιστικές ασθένειες καθώς επίσης και από μια σειρά τοπολογικών μετρικών οι οποίες εντοπίζουν την σημαντικότητα των γονιδίων μέσα σε όλο το δίκτυο. Τα αποτελέσματα της παρούσας εργασίας έδειξαν γονίδια με ισχυρή συσχέτιση με διεργασίες που σχετίζονται με το νευροεκφυλισμό. Η μεθοδολογία υλοποιήθηκε στη γλώσσα R και διατίθεται ως λογισμικό ανοιχτού κώδικα.
  9. Items in Apothesis are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.